Ważniejsze wystawy od 1966 - 1993:

"Ruch ludowy do 1939 r.", "Ceramika Jan Reczkowski, 70 - lecie urodzin", "100 lat turystyki w Polsce", "Michał Rekucki - obrazy oraz pamiątki", "Sztuka ludowa Podhala", "Myślistwo na Podhalu", "Wnętrze izby podhalańskiej", "Władysław Orkan", "500 lat drukarstwa polskiego i 75 lat Drukarni Podhalańskiej", "100 lat muzealnictwa polskiego", "Żydzi nowotarscy", "Budownictwo podhalańskie", "Piotr Borowy - życie i działalność", "Rzeźby Edwarda Sutora", "Grafiki uczniów Liceum Plastycznego w Zakopanem", "100 lat Ochotniczej Straży Pożarnej w Nowym Targu"
1994 - Nowy Targ na przełomie XIX i XX wieku
1996 - Nowotarskie sztandary
1997
- Sztuka sakralna Podhala
- Kapliczki nowotarskie
- Nowy Targ w drukach ulotnych 1939 - 1945
1998
- Ceramika - Jan Reczkowski 1909 - 1997
- 100 lat łowiectwa na Podhalu
- Otwarcie Ikony - malarstwo Krzysztofa Kabata
1999
- Sztuka ludowa Podhala
- Dobro - miłością świata
- Powiat nowotarski w kampanii wrześniowej 1939 r.
2000
- Frywolitka - koronka czółenkowa Jana Stawasza
- Sztuka ludowa ze zbiorów muzeum
- Kościoły polonijne w Archidiecezji Chicagowskiej
- XX lat NSZZ Solidarność
- Chile - kraj szalonej geografii
- Aby nie przepadło na zawsze - Nowy Targ w fotografii Edwarda Morawetza
2001
- Kapłan
- Cracovia sacra
- II podhalańska wystawa modeli redukcyjnych
- Ziemia zbawiciela
- Żel - art. - malarstwo Jana Kantego Pawluśkiewicza
- 120 lat OSP w Nowym Targu
- 35 lat minęło - jubileusz Muzeum Podhalańskiego PTTK w Nowym Targu
2002
- Święte obrazy
- III Podhalańska wystawa modeli redukcyjnych
- Dary dla Ojca Świętego
- Malarstwo Józefa Podkanowicza
- Fotografia Tadeusza Śmiałkowskiego
- Malarstwo Wodyna
2003
- Pędzlem wyczarowane - obrazki na szkle ks. Stanisława Wojcieszaka
- 100 lat lotnictwa - początek skrzydlatego wieku IV Podhalańska wystawa modeli redukcyjnych
- Haftowane obrazy Janiny Tętnowskiej
- Obrazy III - prace Łucji Kuli
- Edward Sutor - rzeźby
- malarstwo Teresy Stankiewicz
- Torfowiska orawsko-nowotarskie - przyroda i człowiek
2004
- Stanislaw Gałek - malarstwo
- V Jubileuszowa Wystawa historyczno-modelarska Koniec wojny - początek
nowej epoki - tajne wynalazki lotnicze 1944/45
- Ojciec Święty Jan Paweł II - malarstwo na szkle ks. Władysława Podhalańskiego
- XIII Prezentacje nowotarskie na 100 lecie Liceum Ogólnokształcącego
- Aleksander Majerski - rzeźba, Wiesław Mamak - malarstwo
- Nowy Targ w malarstwie ze zbiorów muzeum
- Pielgrzymki polskie - fotografie Adama Bujaka
2005
- Mistyczny świat ikony
- Rzeźby z majoliki Anny Dobrzańskiej
- Nowy Targ miasto, ktorego juz nie ma - fotografie ze zbiorów Tadeusza Jędrysko
- Paweł Szadkowski - obrazy i grafiki
- Człowiek i przyroda - 25 lat istnienia parku narodowego w Gorcach
2006
- Unikalne, cenne, ciekawe - dokumenty ze zbiorów Bogusława Giełczyńskiego
- Orzeł Biały - płaskorzeźby Kazimierza Góreckiego
- Nowy Targ na kartach pocztowych ze zbiorów Macieja Żelaznego
- Projekty ubiorów z barana i opakowań oscypka według studentów form przemysłowych ASP w Krakowie
- Oddział PTTK Gorce w Nowym Targu - przeszłość i teraźniejszość
- Patriotyczne karty pocztowe ze zbiorów Macieja Żelaznego
2007
- Sporty zimowe - zabytkowy sprzęt narciarski, sanki i łyżwy z kolekcji Mieczysława Króla Łęgowskiego
- Kobieta na kartach pocztowych - ze zbiorów Macieja Żelaznego
- Tatry Bielskie - fotografie Tadeusza Śmiałkowskiego
- Iwona Bugajska - Bigos - malarstwo i tkanina
- Cerkiewnym szlakiem - fotografie i malarstwo Jolanty Flach
- Zachować tożsamość
- Patriotyczne plakaty ze zbiorów Muzeum Podhalańskiego PTTK
- Z dziejów nowotarskiego rynku
2008
- Modlitwa w rzeźbie strugana - prace Kazimierza Kwatyry
- Fotografie i szkła - Stanisław Gał
- Pod berłem Habsburgów - zbiory młodego kolekcjonera Bartka Rusnaka
- Sztuka łączy miasta - prace artystów z Radevormwal
2009
- Nowy Targ na drodze do niepodległości (2009-2010
- Pejzaż podhalański - malarstwo Józefa Podkanowicza
  2010  
- Edward Sutor - rzeźby
- Nowotarski handel, rzemiosło i usługi w świetle archiwaliów ze zbiorów własnych muzeum
- Fotografia Krystiana Wilka
- Malarstwo na szkle Janiny Marcińczak Maślankowej
- Jarmark Podhalański w obiektywie
- Grafiki i obrazy Pawła Szatkowskiego
- Wojciech Batko "Kształty przestrzeni" - rysunki
- Szalone lata 20-te i 30-te XX wieku - rozrywki nowotarżan
  2011  
- Profesor - doktorzy i doktoranci - interdyscyplinarna wystawa prac
- Święty Ambroży ze zbiorów "Pasieki pod Lasem"
- Wystawa fotografii "Pro Memoria"
- Nowotarski sport w pierwszej połowie XX wieku
- XI Jarmark Podhalański w obiektywie
- Nowy Targ 1939 - 1945
  2012  
- Z historii nowotarskiego szkolnictwa do 1945 r